El Laboratorio de Investigaciones Morfológicas fue creado como una extensión de la Cátedra III de Anatomía, en el año 1974, donde se realizaban trabajos de Investigación en Morfología.
El Dr. Mario Humberto Niveiro, Prof. Titular de la Cátedra III de Anatomía, fue un innovador en esta área de investigación, realizó diversos viajes al exterior, especialmente a Francia donde conjuntamente con el Prof. Couinaud realizaron varios trabajos sobre segmentación hepática y posteriormente formó parte del Laboratorio de Anatomía de París a cargo del Prof. Delmas, en el cual siguió enriqueciendo su formación anatomoquirúrgica.
En el año 1994 se incorpora otro grupo de docentes y colaboradores alumnos desarrollando distintas líneas de trabajo, especialmente orientado a la morfología vascular, Cardiovascular con aplicación quirúrgica y de Bioingeniería, trabajando en conjunto con la Universidad de Tucumán y la Fundación Favaloro.
Con el crecimiento del Laboratorio se comienzan a realizar trabajos de investigación en Morfología Cardiotorácica con Aplicación Quirúrgica, sobre todo en los aspectos anatomoquirúrgicos de la Transplantologia, en donde el Laboratorio, en conjunto con el Laboratorio de Transplantes de Órganos de la misma Facultad, desarrollan un programa de estudio de gran importancia.
El Laboratorio cambia entonces su nombre a Laboratorio de Investigaciones Morfológica Aplicadas por las características de sus estudios y los cursos que se dictan.
En las últimos años el laboratorio comenzó a dictar cursos de pre y posgrado para estudiantes y residentes de distintas especialidades quirúrgicas tales como Cirugía General, Cirugía Torácica, Otorrinolaringología, cardiología y neurocirugía, además de la realización de prácticas anatomoquirúrgicas de importancia para su formación básica.
En el año 2015 se firma un convenio de cooperación entre el laboratorio y la cátedra francesa de la UNESCO de Anatomía numérica para realizar, trabajos en anatomía digital en 3D, intercambios de docentes e investigadores con capacitación continua y redacción conjunta de textos científicos en revistas refenciadas.